viernes, 19 de diciembre de 2014

Bacterias no cultivables: llevamos más de 120 años preparando mal los medios de cultivo

Autoclavar juntos el fosfato y el agar inhibe el crecimiento de las bacterias

Un grupo de investigadores japoneses (1) han descubierto que la preparación de los medios de cultivo con agar, que llevamos haciendo desde los tiempos de Koch, puede inhibir el crecimiento de muchas bacterias. En realidad es un hecho conocido que el número total de células en un cultivo no suele coincidir con las que se cuentan sobre una placa de Petri, pero hasta ahora no sabíamos la razón. Estos autores han descubierto que cuando se autoclavan juntos el fosfato y el agar para preparar un medio sólido, la cantidad de colonias bacterianas totales que se obtiene es 50 veces menor que cuando se autoclavan de forma separada. Autoclavar juntos el agar y el fosfato genera compuestos tóxicos que inhiben el crecimiento bacteriano. El análisis químico sugiere que esta inhibición del crecimiento es debida a la producción de peróxido de hidrógeno (H2O2), un agente oxidante tóxico.

Además, secuenciaron un total de 6.528 colonias bacterias que crecían en los distintos medios. Comprobaron que en los medios con el fosfato autoclavado por separado había más de un 30% de géneros bacterianos clasificados como “no cultivables” que no crecían en los medios con fosfato y agar autoclavados juntos. Han comparado también los resultados de la secuenciación masiva de muestras ambientales con el cultivo. Como cabía esperar, observaron que la secuenciación revelaba muchos más grupos bacterianos que el cultivo: por ejemplo, mediante secuenciación directa fueron capaces de detectar 53 grupos bacterianos en muestras de suelo, pero solo 6 fueron capaces de crecer en los medios de cultivo. Esto confirma la idea de que la mayoría de los microorganismos ambientales son no cultivables.

(1) A hidden pitfall in the preparation of agar media undermines microorganism cultivability. Tanaka T, et al. Appl Environ Microbiol. 2014. 80(24):7659-7666.

miércoles, 10 de diciembre de 2014

Presentación del GEDDI

El Grupo especializado en detección, diagnóstico e identificación de la SEF, nace al amparo de la normativa para la creación de Grupos de Trabajo dentro de la SEF en julio de 2011. Entre los objetivos de este Grupo destaca la organización de reuniones, seminarios, etc. relacionadas con la detección, el diagnóstico y la identificación de patógenos vegetales, la participación en proyectos de investigación coordinados, la publicación de trabajos científicos y divulgativos, la armonización de técnicas de detección y diagnóstico, apoyo a las labores de acreditación y contribución al uso correcto del léxico específico.

En la actualidad el GEDDI-SEF está formado por 109 miembros. Aquellos socios de la SEF que estén interesados en participar en este Grupo o que quieran más información pueden ponerse en contacto en el siguiente correo electrónico: geddi.sef@gmail.com.

El GEDDI-SEF celebra sus Asambleas cada 2 años, haciéndolas coincidir con los Congresos de la Sociedad Española de Fitopatología, y sus Reuniones Científicas los años que no hay Congreso. En la última Asamblea del GEDDI-SEF se renovó a la Junta Directiva, formada por presidente, vocal y secretario.